Les combats dans Nindo Of Shinobi sont composés de deux combattants et d'un arbitre ou témoin. Ce témoin, sera celui qui décidera du vainqueur et qui connaitra les actions secretes des combattants. Les combats s'effectueront tour par tour de la manière suivante:

Citation:

Zabuza lanca un shuriken vers Kakashi. _"Tu es fichu!" [HRP: Le joueur dit son action secrete par MP au témoin]

Citation:

Kakashi attrapa le shuriken avec un doigt. [HRP:Le Témoin dit ensuite l'action secrete de Zabuza.] Soudain, le shuriken explosa, il était muni d'un parchemin explosif.

Il est impossible que les combats se déroule sans arbitre, mais il est possible qu'il y ait plus de deux combattants dans un combat. Celui qui commence est toujours l'assaillant. Il est aussi impossible qu'un gamin de 8 ans puisse battre un anbu par exemple:

Citation:

Konohamaru donna un coup de pied dans les bijoux de familles d'Itachi qui s'effondra à terre, une larme à l'oeil.

Ceci sera impossible et sera puni d'un avertissement verbale.